由于通风柜在生化实验室中占有非常重要的位置，从改善实验室环境、改善劳动卫生条件，提高工作效率等方面考虑，通风柜的使用台数飞跃地增加。随之而来的是通风管道，配管、配线、排风等都成为实验室建设的重要课题。

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即使在具有特殊通风柜设计的设备中，只有在有效使用设备的情况下才能实现高效率。遵循正确的操作程序是关键。

每种类型的通风柜都有自己的一套制造商的说明和程序。当通风柜内部有大型设备时，将架子放在设备下方，以便空气可以在其下方流动。

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在医学器械行业中，通风柜是洁净实验室设备中必不可少的组成部分，为了使实验室工作人员不吸入或咽入一些有毒的、可致病的或毒性不明的化学物质和有机体，实验室中应有良好的通风。为阻止一些蒸汽、气体、和微粒的吸收，污染物质必须使用通风柜、通风罩或局部通风的方法除去。